Dr. Abraham Vidal Limón

  • Centro de Nanociencias y Nanotecnología
  • Departamento de Nanoestructuras
  • Investigador
  • SNI C
  • avidal@cnyn.unam.mx

Simulación molecular de sistemas biológicos.

Mis intereses de investigación se centran en el estudio teórico-experimental de sistemas biológicos (proteínas y enzimas, DNA, metabolitos secundarios, etc). Utilizando métodos químico-computacional (DM, dinámica molecular y acoplamiento molecular), hemos reportado las interaciones intermoleculares del tipo receptor-ligante entre varios receptores humanos y compuestos xenobióticos, así como metabolitos secundarios.

Otra área de mi interés es la determinación de las rutas de transferencia de electrones entre centros organometálicos y la matriz proteica de las enzimas oxidoreductasas (métodos híbridos QM/MM), con el objetivo de modificarlas posteriormente mediante técnicas de DNA recombinante y mejorar su actividad y estabilidad.

Publicaciones más relevantes

  • Vidal-Limon, A.M. ; Garcia S. P. C; Arellano-García, E; Contreras, O, E; Aguila, S.A. Enhanced Degradation of Pesticide Dichlorophen by Laccase Immobilized on Nanoporous Materials: A Cytotoxic and Molecular Simulation Investigation. 2018. Bioconjugate Chemistry. 29 (4) 1073-1080.
  • Vidal-Limon, A.M.; Tafoya, P; Santini, BL; Contreras, O.E.; Aguila S.A. Electron transfer pathways analysis of oxygen tolerant [NiFe]-hydrogenases for hydrogen production: A quantum mechanics/molecular mechanics – statistical coupled analysis. 2017. International Journal of Hydrogen Energy. 42(32) 20494-20502.
  • Vidal-Limon, A.M. ; Águila, S.; Ayala, M.; Batista, Cesar V. and Vazquez-Duhalt R. Peroxidase activity stabilization of cytochrome P450BM3 by rational analysis of intramolecular electron transfer. 2013. Journal of Inorganic Biochemistry. 122. 18–26.

Clases impartidas referentes a la línea de investigación

  • Simulación molecular de sistemas biológicos.
  • Teoría clásica de la intereacción intermolecular.